Funky Monkey er en gakket familiefilm, som er spækket med action. Den begynder med at chimpansetræneren Alec McCall redder Clemens fra ZIT (De foretrækker nu, at man kalder dem Zoology International Technology), et ondsindet internationalt foretagende, som agter at forvandle chimpansen til et våben, så de kan erobre hele verden. Mens de er på flugt, finder parret en mission, som er langt mere kompliceret end noget, Zit kunne have udtænkt: Den nørdede Michael skal lære at dele alvorlige øretæver ud og score sin drømmepige. Men det tegner til at blive en umulig mission, da ZIT's bøller dukker op - og de nøjes ikke med abekattestreger.
