Az 1943-as II. világháborús Philadelphia kísérletet próbálja újraéleszteni napjainkban az amerikai kormány egy titkos projekt keretein belül. Az eredeti kísérlet egy olyan mágneses védőpajzs kifejlesztésére irányult, amelynek köszönhetően hadihajókat tehetnek láthatatlanná. A sikeres kormánykísérlet következtében kísértetként bukkan fel a múltból az első kísérlet alanya, az 1943-as Eldridge romboló, rajta egyetlen túlélővel, Bill Gardnerrel. A kísérletekért felelős Kathryn Moore kezéből hamarosan kicsúszik az irányítás, a különböző városok mellett véletlenszerűen felbukkanó hadihajót képtelen irányítani, az hatalmas pusztítást végez a XXI. században. A katasztrófát csak a halottnak hitt tudós, Salinger, az egykori hadihajó egyetlen túlélője és az unokája tudja megállítani.
