In de stad Minato Mirai in Yokohama is het nieuws over de nederlaag van Fusion tegen de Pretty Cures het populairste onderwerp in de stad! Overal zijn meisjes verliefd op de Pretty Cures, ze verkleden zich en treden op als hun favoriete Cures. Alleen Sakagami Ayumi, de nieuwe transferstudent, is alleen. Op weg naar huis van school komt Ayumi een vreemd wezen tegen. Nadat ze het Fuu-chan hebben genoemd, worden Ayumi en het wezen al snel goede vrienden. Fuu-chan is echter eigenlijk een stukje Fusion en bezit de kracht van duisternis. In een poging Ayumi gelukkig te maken, slikt Fuu-chan alles op wat Ayumi niet leuk vindt, waardoor er chaos ontstaat op school en in de hele stad! Om Ayumi's ware gevoelens aan Fuu-chan over te brengen, werden alle 28 Pretty Cures opnieuw verzameld. Wanneer de krachten van iedereen samenkomen, begint er een wonderbaarlijk licht te schijnen.
