Gebaseerd op waar gebeurde feiten, vertelt The Hunt For The Unicorn Killer het schokkende verhaal van Ira Einhorn, een gerespecteerd Amerikaans vredeactivist in het Amerika van de jaren zeventig. Hij leeft samen met Holly Maddux (Naomi Watts), maar wanneer die hem tracht te verlaten in 1977, verdwijnt ze plotseling onder mysterieuze omstandigheden. Wat later wordt haar levenloze lichaam aangetroffen in een koffer in de flat van Einhorn, die ondertussen het land is uitgevlucht en er de daaropvolgende jaren op listige wijze in slaagt de instanties steeds een stap voor te blijven. Holly's vader blijft echter vastbesloten om gerechtigheid te laten geschieden in naam van zijn dochter en na een lange klopjacht vindt hij de 'unicorn killer' in 1997 in Frankrijk.
