Центральний персонаж фільму - найманий вбивця, генетично створений як ідеальна вбивча машина та відомий лише за останніми двома цифрами штрих-коду, татуйованого на задній стороні його шиї. Він – кінцевий продукт багаторічних досліджень, наступник попередніх сорока шести Агентів-клонів, наділений неперевершеною силою, швидкістю, витримкою та розумом. Його чергова ціль – мегакорпорація, яка планує розкрити таємницю історії Агента 47, аби створити армію вбивць, чиї можливості перевершать навіть його власні. Об’єднавшись із молодою жінкою, яка, можливо, володіє таємницею, як подолати їхніх потужних та прихованих ворогів, Агент 47 дізнається про вражаючі подробиці власного походження та вступає у героїчну битву зі своїм найнебезпечнішим супротивником.
